Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms