Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms