Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIS18AQ9NYP9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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MIS18AQ9NYP9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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MIS18AQ9NYP9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIS18AQ9NYP9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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