Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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