Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms