Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms