Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms