Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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