Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3GQ9HC16 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms