Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms