Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIPCQ9C0C6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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