Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP1Q9C000 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms