Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms