Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms