Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms