Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms