Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf36Q96KX1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms