Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM5Q96HS1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM5Q96HS1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGAM5Q96HS1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms