Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms