Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP13Q92995 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP13Q92995 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP13Q92995 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms