Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT9Q92600 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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