Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN4Q8WUT4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms