Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC12Q8WUD4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms