Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER1Q8TC90 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms