Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms