Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms