Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD12Q8N8I0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms