Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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