Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP1Q86WV1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms