Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms