Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms