Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms