Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAD11Q709F0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms