Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms