Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms