Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms