Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms