Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms