Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF123Q5XPI4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF123Q5XPI4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms