Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AGAP9Q5VTM2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms