Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM164Q5U3C3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms