Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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