Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms