Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFT2D3Q587I9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms