Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC39A12Q504Y0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A12Q504Y0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms