Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms