Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CA9Q16790 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CA9Q16790 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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CA9Q16790 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CA9Q16790 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CA9Q16790 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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