Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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