Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FXNQ16595 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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