Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACKR1Q16570 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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